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全基因組甲基化測序

技術(shù)簡介

DNA 甲基化是一種非常重要的表觀遺傳修飾方式，在維持正常細(xì)胞功能、遺傳印記、胚胎發(fā)育以及人類腫瘤發(fā)生中起著重要的作用。全基因組甲基化測序 (Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS) 是將重亞硫酸氫鹽處理方法與高通量測序平臺(tái)相結(jié)合，對(duì)有參考基因組物種的DNA 甲基化狀態(tài)進(jìn)行全基因組范圍內(nèi)檢測，為眾多生物學(xué)過程、人類健康與疾病的表觀遺傳機(jī)制研究提供強(qiáng)有力的技術(shù)手段。

技術(shù)路線

送樣建議

技術(shù)參數(shù)

案例分析

單細(xì)胞WGBS 揭示細(xì)胞分化過程中的表觀遺傳調(diào)控^[1]

研究背景            

單細(xì)胞基因組測序和轉(zhuǎn)錄組測序熱潮技術(shù)加深了我們對(duì)細(xì)胞異質(zhì)性研究的認(rèn)識(shí)，然而單細(xì)胞表觀基因組的研究我們卻知之甚少。

研究目的

本研究證實(shí)WGBS技術(shù)在小細(xì)胞群（μWGBS）和單細(xì)胞（scWGBS）異質(zhì)性表觀遺傳學(xué)研究中的應(yīng)用的可行性，并且提供新的分析思路，為單細(xì)胞甲基化研究打下堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。

研究結(jié)果

通過對(duì)人和小鼠體內(nèi)單細(xì)胞進(jìn)行WGBS研究，揭示細(xì)胞分化的異質(zhì)性和表觀遺傳修飾的相關(guān)性，并首次繪制人體細(xì)胞scWGBS的甲基化譜。

單細(xì)胞WGBS技術(shù)流程圖

參考文獻(xiàn)

[1]. Farlik, M. et al. Single-cell DNA methylome Sequencing and bioinformatic inference of epigenomic cell-state dynamics. Cell Rep , 2015, 10:1386-1397,doi:10.1016/j.celrep.2015.02.001 .