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廣泛靶向代謝組學(xué)

技術(shù)簡(jiǎn)介

廣泛靶向代謝組學(xué)（Widely targeted metabonomics）是一種整合了非靶向代謝組學(xué)“廣泛性”和靶向代謝組學(xué)“準(zhǔn)確性”檢測(cè)技術(shù)優(yōu)點(diǎn)的新型代謝組檢測(cè)技術(shù)，屬于新一代代謝組檢測(cè)技術(shù)。項(xiàng)目實(shí)測(cè)結(jié)果可達(dá)一次性定性定量檢測(cè)800-1200種代謝物質(zhì)。

技術(shù)原理

將目標(biāo)化合物的質(zhì)譜參數(shù)（RT、Q1、Q3）信息添加進(jìn)廣靶數(shù)據(jù)庫(kù)中，構(gòu)建一個(gè)包含數(shù)據(jù)庫(kù)中所有化合物信息的質(zhì)譜方法。基于已構(gòu)建數(shù)據(jù)庫(kù)及檢測(cè)方法，采用MRM掃描模式采集樣本代謝組數(shù)據(jù)，獲得物質(zhì)的定性及相對(duì)定量結(jié)果。

服務(wù)產(chǎn)品：

技術(shù)特點(diǎn)

通量高，數(shù)據(jù)庫(kù)大：廣靶數(shù)據(jù)庫(kù)收錄幾千種代謝物，含大量次生代謝物

分辨率、靈敏度高：檢測(cè)下限達(dá)pg級(jí)，可發(fā)現(xiàn)更多低豐度代謝物

定性定量準(zhǔn)：AB 6500+三重四極桿定量；自建標(biāo)品數(shù)據(jù)庫(kù)準(zhǔn)確定性結(jié)果

覆蓋廣，注釋信息全面：覆蓋KEGG中90%以上pathway，通路及功能分析準(zhǔn)確可靠

技術(shù)路線：

送樣建議：

（1）樣本量要求：

血清/血漿：200 μL/sample

尿液：1mL/sample

動(dòng)物組織：200mg/sample

糞便/腸道內(nèi)容：200mg/sample

植物組織：1-2g/sample

（2）生物學(xué)重復(fù)：

植物：建議8個(gè)以上，不低于6個(gè)

動(dòng)物：建議12個(gè)以上，不低于8個(gè)

臨床樣品：建議100個(gè)以上，不低于30個(gè)

案例分析

廣泛靶向的代謝組學(xué)分析尸體分解對(duì)不同類型水體中代謝特征的影響^[1]

研究背景

動(dòng)物尸體在降解過程中會(huì)產(chǎn)生許多有毒有害的代謝物，對(duì)水安全構(gòu)成潛在的生態(tài)風(fēng)險(xiǎn)，從而威脅人類健康。然而，動(dòng)物尸體分解產(chǎn)生的代謝物尚不清楚。

研究目的

       選擇了尸體分解最終階段（第19天）的樣本來(lái)研究代謝特征并以魚類為動(dòng)物模型，通過廣泛靶向的代謝組學(xué)，揭示兩種水（黃河水和自來(lái)水）中水質(zhì)、微生物和有害代謝物之間的關(guān)系。

研究結(jié)果

結(jié)果顯示氨基酸代謝組學(xué)、吲哚及其衍生物、吡啶和吡啶衍生物主要發(fā)生在尸體組中，表明這些代謝物是尸體分解的標(biāo)志物。一些有害代謝物（如多胺、胺類、苯和取代衍生物）與尸體分解高度相關(guān)，這揭示了如何研究水中有害物質(zhì)的新見解。這項(xiàng)工作表明，尸體分解通過產(chǎn)生各種有毒代謝物導(dǎo)致水質(zhì)惡化，從而為暴露于水生環(huán)境中的動(dòng)物尸體時(shí)的有毒代謝物提供了新的見解。

圖1 廣泛靶向代謝組學(xué)分析尸體分解產(chǎn)生有毒代謝物整體思路

參考文獻(xiàn)

[1] Zhou R, Yu Q, Li T, et al. Carcass decomposition influences the metabolic profiles and enriches noxious metabolites in different water types by widely targeted metabolomics[J]. Chemosphere, 2020, 269:129400.